Attività di ricerca
Biofilm microbici: caratterizzazione e dinamica della diversità microbica tramite ibridazione in situ ed analisi di sequenze geniche
Area tematica
☒ Ambiente
☐ Agrobio
☐ Beni Culturali
☐ Materiali funzionali
☐ Salute e Benessere
Referente Attività
Stefano Fazi
Istituto di Ricerca sulle Acque (IRSA)
Tel.: +39 06 90672790
E- mail: fazi@irsa.cnr.it
Facilities
Laboratorio di Ecologia Microbica e Microscopia ad epifluorescenza.
Competenze
Analisi dei biofilm microbici in ambienti naturali ed artificiali (incluso ambienti estremi) tramite microscopia e analisi delle sequenze (gene 16S rRNA). Il metodo consente l’identificazione e la localizzazione dei microrganismi, mantenendo inalterata l’architettura 3D del biofilm. Si studia lo sviluppo dei biofilm, la dinamica di microrganismi (incluso patogeni), le interazione con metalli e nanoparticelle. Applicazioni in campo ambientale, biotecnologico, sanitario, beni culturali.
Progetti di riferimento
- Census of Deep Life Sequencing – The Deep Carbon Observatory: A geomicrobiological study on soils and sediments affected by hydrothermal fluids: life adaptation in extreme environments (USA).
- EU-COST Action CA15219 – Developing New Genetic Tools for Bioassessment of Aquatic Ecosystems in Europe (DNAqua-Net)
- Progetto Bandiera RITMARE
Articoli di riferimento significativi
- Fazi S., S. Amalfitano, J. Pernthaler, A. Puddu, 2005. Bacterial communities associated with benthic organic matter in headwater stream microhabitats. Environmental Microbiology 7(10): 1633-1640
- Fazi S., S. Crognale, B. Casentini, S. Amalfitano, F. Lotti, S. Rossetti, 2016. The Arsenite Oxidation Potential of Native Microbial Communities from Arsenic-Rich Freshwaters. Microbial Ecology 72 (1), 25-35
- Pizzetti I., F. Schulz, T. Tyml, B. M. Fuchs, R. Amann, M. Horn, Fazi, 2016. Chlamydial seasonal dynamics and isolation of Candidatus Neptunochlamydia vexilliferae’ from a Tyrrhenian coastal lake. Environmental Microbiology 18(8), 2405–2417
Collaborazioni principali
RICERCA:
- Università di Barcellona e Girona (Spagna)
- Università di Vienna (Austria)
- Max Planck institute for Marine Microbiology (Germania)
